Nakon veličanstvene karijere Ljubek je postao sportski dužnosnik. Sudjelovao je u osnivanju Hrvatskog olimpijskog odbora (HOO) 1991. godine. Neposredno prije osobne tragedije, kao zapolsenik HOO-a, uspješno je odradio posao šefa Misije hrvatskog olimpijskog izaslanstva na OI u Sydneyju 2000. godine. U studenome iste godine trebao je napuniti 47 godina...
Uz Ljubekovu obitelj i prijatelje, tužnu obljetnicu tradicionalno obilježavaju Hrvatski kajakaški savez (HKS) i HOO. Predsjednik HKS-a Marko Ćurković i glavni tajnik Branko Lovrić položili su i vijenac HOO-a na Ljubekovo posljednje počivalište na zagrebačkom Mirogoju.
U znak trajnog sjećanja na legendarnog olimpijca Hrvatski olimpijski odbor nazvao je njegovim imenom jednu od svojih godišnjih nagrada, a u Zagrebu uspješno djeluje i KKK Matija Ljubek. U godini tragičnog odlaska Matija Ljubek je posthumno dobio i Državnu nagradu sporta Franjo Bučar za životno djelo. (hoo/vk)
